ガニメデ星の支配者ヘドロン皇帝の指揮するコンギスター軍団は地球に侵攻95%を占領地球の主要エネルギー源である原子力を封じるために原子炉を破壊するオメガミサイルを装備した監視ミサイル衛星を衛星軌道上に配置したコンギスター軍団の占領から唯一逃れた日本で敷島博士は地球を取り戻すために空母キングダイヤモンドと超性能戦闘ロボット『メカンダーロボ』を建造しコンギスター軍団に立ち向かう